วิธีส่งผลต่อการสังเคราะห์ LPS ของ GNB เพื่อให้ LPS และ GNB สามารถจดจำและล้างข้อมูลได้ง่ายโดยโฮสต์ยังเป็นมาตรการในการรักษาภาวะเอนโดทอกซีเมีย ในภาวะเอนโดทอกซีเมียที่เกิดจากเชื้อเอนธีโอเจนิก เชื้อ Escherichia coli (E.coli) มีโครงสร้าง LPS ทั่วไป ซึ่งง่ายต่อการหลบหนีจากปฏิกิริยาการกวาดล้างเซลล์ทำลายเซลล์ของโฮสต์ แสดงกิจกรรมทางชีวภาพที่รุนแรงของเอนโดท็อกซิน และทำให้เกิดผลกระทบที่เป็นพิษต่างๆ ดังนั้น ในการศึกษาเอนโดทอกซิน LPS ของ E. coli มักจะใช้เพื่อประเมินผลทางชีวภาพของเอนโดท็อกซินและประเมินมาตรการแทรกแซงต่างๆ เมื่อ GNB จากภายนอกติดเชื้อ โครงสร้าง LPS ของมันจะขาดโครงสร้าง LPS ทั่วไป และความเป็นพิษของมันค่อนข้างต่ำ ซึ่งโฮสต์จะกำจัดออกได้ง่าย

Seydel นักวิชาการชาวเยอรมันและคณะ วางโมเลกุลขนาดใหญ่รวมของ LPS ในน้ำเกลือทางสรีรวิทยา ใช้ IL-6 ที่หลั่งออกมาโดยมาโครฟาจเป็นตัวบ่งชี้ และใช้เทคโนโลยีการเลี้ยวเบนรังสีเอกซ์ของรังสีซินโครตรอนเพื่อวิเคราะห์โครงสร้างสามมิติของ LPS ที่แตกต่างกัน พบว่า LPS ที่มีโครงสร้างรูปกรวยมีความเป็นพิษทางชีวภาพที่รุนแรง ในขณะที่โครงสร้างทางเคมีแบบลูกบาศก์ของโครงสร้างทรงกระบอกไม่มีความเป็นพิษหรือมีความเป็นพิษต่ำ Hexaacyl lipid A จาก E.coli เป็นโครงสร้างลูกบาศก์กลับหัว ในขณะที่ pentadactyl lipid A และ tetradecyl lipid A จาก E.coli ก่อตัวเป็นโครงสร้างหลายชั้น และมีแนวโน้มที่จะมีโครงสร้างเป็นไมเซลล์เล็กน้อย อย่างไรก็ตาม c.jejuni lipid A เป็นโครงสร้างเดียวที่มีแนวโน้มเล็กน้อยที่จะพัฒนาเป็นโครงสร้างลูกบาศก์กลับหัว ลิพิด A อื่นๆ ทั้งหมดก่อตัวเป็นโครงสร้างหลายชั้นโดยไม่มีข้อยกเว้น ลิพิด A ของแบคทีเรียในลำไส้แต่ละเฮกซาเดซิลเป็นรูปกรวยหรือเว้า ไขมันเพนทาแดกทิลส่วนใหญ่เป็นทรงกระบอก และไขมันเตตระเดซิลเอเป็นทรงกระบอก และมีแนวโน้มที่จะพัฒนาเป็นทรงกรวยหรือนูน (ส่วนตัดขวางของโซนที่ไม่ชอบน้ำจะเล็กกว่านั้นเล็กน้อย ของโซนที่ชอบน้ำ)

ข้อมูลปัจจุบันแสดงให้เห็นว่ามีหลักการทั่วไปสำหรับ LPS ในเอนโดทอกซิน ไขมัน A มีรูปร่างเป็นกรวยหรือเว้าเท่านั้นที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพสูง เช่น เชื้ออีโคไลในลำไส้ LPS ไม่มีกิจกรรมตัวเอกและเกี่ยวข้องกับรูปทรงกระบอกของลิปิด A การที่ LPS ไม่มีหมู่เอซิลไม่ได้หมายความว่าสามารถใช้เป็นตัวต้านได้ อาจเป็นไปได้ว่าเมื่อเอนโดทอกซินถูกทำให้อยู่ภายในเซลล์โมโนไซต์, มาโครฟาจ, นิวโทรฟิล และเซลล์เดนไดรต์ เอ็นโดทอกซินจะถูกไฮโดรไลซ์ด้วยเอนไซม์โดยอะซิลคาร์บอกซิลไฮโดรเลส (AOAH) เพื่อผลิตดีเอซิลลิพิดเอ และในขณะเดียวกันก็เปลี่ยนสัณฐานวิทยาสามมิติของมัน ในขณะนี้ไม่มีพิษ จะเห็นได้ว่าการมีหรือไม่มีหมู่อะซิลใน LPS ไม่ได้หมายความว่าไม่เป็นพิษ จำเป็นต้องเข้าใจโครงสร้างสามมิติของมัน

ผลกระทบทางชีวภาพของเอนโดท็อกซินและปริมาณประจุลบของ LPS จำนวนสายอะซิล การกระจายของหมู่อะซิล ระดับความอิ่มตัวของกรดไขมันของสายอะซิล และการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างสเตอริโอ ล้วนส่งผลต่อกิจกรรมของเอนโดทอกซิน ข้อสรุปนี้สามารถสร้างพื้นฐานทางทฤษฎีสำหรับการออกแบบแอนะล็อก LPS และทำให้พวกมันต่อต้านผลกระทบของ LPS ที่เป็นพิษได้