สารละลายที่เป็นกลางของลิโพโพลีแซคคาไรด์สามารถเก็บไว้ที่อุณหภูมิห้องเป็นเวลาหลายเดือน และฤทธิ์ทางชีวภาพของมันไม่เปลี่ยนแปลงอย่างมีนัยสำคัญ หากเก็บไว้ที่อุณหภูมิ 4 ℃ หรือในตู้เย็นอุณหภูมิต่ำ กิจกรรมทางชีวภาพจะไม่เปลี่ยนแปลงเป็นเวลาหลายปีจนถึงหลายทศวรรษ ผงที่เป็นกลางของ lipopolysaccharide แบบแห้งสามารถเก็บไว้ที่อุณหภูมิห้องหรือตู้เย็นได้นานหลายทศวรรษหรือนานกว่านั้นโดยไม่สูญเสียฤทธิ์ทางชีวภาพ

เมื่อใส่ lipopolysaccharide ลงในสารละลายที่เป็นกรดที่อุณหภูมิห้อง โมเลกุลของ lipopolysaccharide จะเกิดการย่อยสลายบางส่วน การเปลี่ยนแปลงนี้ส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับการแตกพันธะไกลโคซิดิกระหว่างพอลิแซ็กคาไรด์และลิพิด A และความแตกแยกของพันธะลิพิด A1-กลูโคไซด์ ความร้อนสามารถกระตุ้นปฏิกิริยานี้ได้ สารละลายกรดแก่สามารถทำลาย lipopolysaccharide ได้อย่างสมบูรณ์ภายใต้สภาวะความร้อน

ปัจจัยที่เป็นด่างมีอิทธิพลอย่างมากต่อโมเลกุลของไลโปโพลีแซคคาไรด์ โดยส่วนใหญ่อยู่ที่โมเลกุลของไขมัน A ในขณะนี้ พันธะเอสเทอร์ 4 ฟอสเฟตบนโครงกระดูกลิพิด A และพันธะเอสเทอร์ของกรดไขมันที่ตำแหน่ง 3 และ 3 ถูกทำลายได้ง่าย ซึ่งอาจทำให้โมเลกุลแตกตัวได้ ในเวลานี้ โมเลกุลที่ย่อยสลายจะสูญเสียกิจกรรมของเอนโดท็อกซินทั่วไป ไลโปโพลีแซคคาไรด์สามารถถูกทำลายได้อย่างสมบูรณ์ภายใต้สภาวะที่เป็นด่างรุนแรง