เมื่อพอลิเมอร์แอนติเจน O เชื่อมต่อกับแกนของลิพิด A แล้ว ก็จะหยุดปฏิกิริยาพอลิเมอไรเซชัน กล่าวคือปฏิกิริยาเชื่อมต่อสามารถยุติปฏิกิริยาพอลิเมอไรเซชันได้ ทั้งแกนของลิพิด A และลิโพโพลีแซคคาไรด์ที่มีหน่วยทำซ้ำที่มีความยาวต่างกันสามารถถ่ายโอนไปยังเยื่อหุ้มชั้นนอกได้อย่างมีประสิทธิภาพ ดังนั้นจึงสามารถเห็นขนาดโมเลกุลของ lipopolysaccharide ได้ด้วย SDS-PAGE ซึ่งเกิดจากความแตกต่างของระบบการสังเคราะห์ทางชีวภาพมากกว่าปัจจัยของระบบผลผลิต

การกระจายของห่วงโซ่ด้านข้างของ O แอนติเจนในแบคทีเรียต่างๆ นั้นแตกต่างกัน บางชนิดมีหน่วยซ้ำประมาณ 20 หน่วย และบางส่วนอาจมีหน่วยซ้ำประมาณ 100 หน่วย ใน SDS-PAGE อิเล็กโตรโฟรีซิส จะสะท้อนถึงความแตกต่างของความเข้มของการย้อมสีซิลเวอร์ของโมเลกุลต่างๆ ของแบคทีเรียต่างสายพันธุ์ เหตุผลสำหรับการกระจายที่แตกต่างกันของความยาวสายด้านข้างของ O แอนติเจนในแบคทีเรียที่แตกต่างกัน อาจเป็นเพราะมีปัจจัยการเลือกขนาดในกระบวนการของ O แอนติเจนโพลีคอนเดนเซชันหรือปฏิกิริยาการเชื่อมต่อ Wzz (เช่น Rol หรือ Cld) เป็นโปรตีนสำคัญที่ควบคุมการกระจายของความยาวสายด้านข้างในแบคทีเรียที่สังเคราะห์แอนติเจนผ่านทาง Wzy dependent pathway แต่กลไกเฉพาะของมันยังไม่ชัดเจน