ไขมันในแบคทีเรียในลำไส้ทั่วไป A คือ 1,4-diphosphate- β 1,6 ที่เชื่อมโยงกับไกลโคซามิโนไดแซ็กคาไรด์เป็นแกนหลัก และเชื่อมโยงกรดไขมัน 3-ไฮดรอกซีหรือสารตกค้าง 3-acyl carboxyl ด้วยพันธะเอไมด์และเอสเทอร์ โครงสร้างนี้ไม่ปกติในแบคทีเรียแกรมลบทั้งหมด โดยเฉพาะอย่างยิ่งโครงสร้างข้างต้นมักไม่พบในครอบครัวที่อยู่ห่างไกลจากแบคทีเรียโคลิฟอร์ม เช่น Bradyrhizobia

ในตอนแรก โครงสร้างของไขมัน A ที่ได้รับนั้นถูกพิจารณาว่าเป็นไขมันชนิด A ที่ "ผิดปกติ" และตอนนี้มันถูกเปลี่ยนชื่อเป็นตัวแปรของไขมัน A ตัวอย่างเช่น Thiobacillus, Rhizobiaceae, Nitrobacter, Brucella, Chromatim Party, Chlorobium N ad son เป็นต้น มีการเปลี่ยนแปลงที่เห็นได้ชัดในโครงสร้างโครงกระดูกของ LPS และการทดแทน ตัวแปรไขมัน A มีรูปแบบการเปลี่ยนผ่าน (หรือเปลี่ยนรูป) ใน Rhodobacter sphaeroides กรดไขมัน 3-ไฮดรอกซีที่เชื่อมโยงกับเอไมด์เพียงบางส่วนเท่านั้นที่ถูกแทนที่ด้วยกรด 3-ออกซีไมริสติก ในฐานะที่เป็นไขมัน, โครงกระดูกโพลีแซคคาไรด์, ไกลโคซามีนของแบคทีเรียที่มีเม็ดสีจะมาพร้อมกับการเชื่อมต่อ 2,3-diamino-2,3-dideoxy-D-glucose (DAG) จำนวนเล็กน้อยเสมอ

DAG มีอยู่ในไขมันโครงกระดูกน้ำตาลเท่านั้น อนุพันธ์ของกรดยูริกของ 2,3-diamine-2,3-dideoxhexose ได้รับการรายงานว่าเป็นแอนติเจนของแบคทีเรีย (สาย O) ของเชื้อ Pseudomonas aeruginosa ในซีโรไทป์ที่แตกต่างกัน

3- กรด oxymyristic: มีรายงานการมีอยู่ของกรด 3-oxymyristic เป็นครั้งแรกในแบคทีเรีย Listenella anguillarum และ erythroid ในความเป็นจริงแล้ว สามารถสังเกตกิ่งก้านของแบคทีเรียแกรมลบ α- 3 ทุกสายพันธุ์และทุกสายพันธุ์ได้

เอนโดทอกซินที่มีผลทางชีวภาพที่สำคัญที่สุดคือ LPS ต่างกัน ซึ่งมักใช้เป็นมาตรฐานในการทดสอบปฏิกิริยาของเซลล์และดำเนินการวิจัยเกี่ยวกับผลการรักษา ส่วนกิจกรรมทางชีวภาพของไขมัน A ประกอบด้วย β- 1,6 ประกอบด้วย D-กลูโคซามีนไดแซ็กคาไรด์และกรดไขมันอิ่มตัวหกชนิดและอนุมูลฟอสเฟตที่มีประจุลบสองชนิด การเปลี่ยนแปลงในการจัดเรียงโครงสร้างเหล่านี้ เช่น การลดลงของจำนวนประจุ การลดลงของกลุ่มไขมันอะซิล การเปลี่ยนแปลงการกระจายของสายโซ่อะซิลของไขมัน และระดับความอิ่มตัวของไขมันอะซิลสามารถนำไปสู่การลดลงทางชีวภาพของพวกมัน กิจกรรม. แสดงให้เห็นว่าการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างหลักของเอนโดท็อกซินจะส่งผลต่อการกระทำทางเคมีกายภาพอย่างหลีกเลี่ยงไม่ได้ เซย์เดลและคณะ ยืนยันว่าโครงสร้างสเตอริโอของ LPS ในเอนโดทอกซินนั้นสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดกับผลกระทบทางชีวภาพของมัน โครงสร้างสามมิติที่แตกต่างกันสามารถสร้างเอฟเฟกต์ที่แตกต่างกันได้ โดยทั่วไป โครงสร้างเชิงพื้นที่ทรงกรวยมักจะนำไปสู่การกระตุ้นการทำงานของเซลล์ ในขณะที่โครงสร้างเชิงพื้นที่ทรงกระบอกของ LPS มักจะเป็นตัวต่อต้านของเอนโดทอกซินเพื่อยับยั้งการกระตุ้นการทำงานของเซลล์