ในช่วงสิบปีที่ผ่านมา การวิจัยเกี่ยวกับเอนโดทอกซินมุ่งเน้นไปที่เส้นทางการสังเคราะห์ทางชีวภาพของไขมัน E. coli K-12 เป็นหลัก

ในกระบวนการสังเคราะห์ทางชีวภาพของผิวเซลล์ UDP-N-acetylglucosamine (UDP-GlcNAc) เป็นตัวกลางที่สำคัญและเป็นสารตั้งต้นทั่วไปของ peptidoglycan และ lipid A ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการสังเคราะห์พอลิแซ็กคาไรด์ที่พื้นผิว ในโพลีแซคคาไรด์หลักของ LPS และ О CleNAc มีบทบาทสำคัญในการจับแอนติเจน

UDP-GlcN และ β- Hydroxytetradecanoic acid-carrier โปรตีน （ β- โมเลกุลสารตั้งต้นของการสังเคราะห์ลิพิด A เช่น โปรตีนพาหะไฮดรอกซีไมริสโทอิล-เอซิล, ไฮดรอกซีไมริสโทอิล-ACP) สร้างลิพิด A ผ่านชุดปฏิกิริยาต่อไปนี้:

1. การก่อตัวของ UDP - monoacyl acetylglucosamine

UDP-GlcNAc คือ β- Hydroxytetradecanoic-apolipoprotein β Hydroxytetradecanoic acid acylation สร้าง UDP-3-monoacyl-GleNAc ปฏิกิริยานี้ถูกเร่งปฏิกิริยาโดยอะซิลทรานสเฟอเรส ยีน A หละหลวมซึ่งอยู่ที่โครโมโซม 4 นาทีเข้ารหัสอะซิลทรานสเฟอเรส

2. การผลิต UDP-2, 3-diacyl glucosamine และ lipid X

UDP-monoacyl acetylglucosamine จะถูก deacetylated บนหมู่อะมิโนภายใต้การเร่งปฏิกิริยาของ N-deacetylase ที่เข้ารหัสโดยยีน lpxC จากนั้นจึงถ่ายโอนไปยังกลุ่มอะมิโนภายใต้การเร่งปฏิกิริยาของผลิตภัณฑ์ที่เข้ารหัสโดยยีน lpxD β- Hydroxytetradecanoic acid จึงผลิต UDP - diacyl glucosamine (UDP - 2, 3 - ไดอะซิล - GlcN) UDP ของ UDP-lipoacylglucose ถูกกำจัดออกโดย pyrophosphatase เพื่อผลิต 1-phospho-2,3-dilipoacylglucosamine ซึ่งเป็นที่รู้จักกันทั่วไปว่าเป็น lipid X (lipid x)

3. การก่อตัวของไขมัน Ⅳ a

UDP-2, 3-diacyl glucosamine และ lipid X ผ่าน β- พันธะ 1,6 pyrophosphate เชื่อมต่อกันและควบแน่นเพื่อสร้างโครงกระดูกของ lipid ขณะนี้มีน้ำตาลอยู่ 2 ในแต่ละหมู่ β- Hydroxytetradecanoic acid ลดกลูโคซามีน มีหมู่ฟอสเฟตที่ตำแหน่ง C-1 ปฏิกิริยานี้ถูกกระตุ้นโดยโปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีน lpxB จากนั้นภายใต้การเร่งปฏิกิริยาของไคเนสที่เฉพาะเจาะจง ตำแหน่ง C-4 ของกลูโคซามีนที่ไม่รีดิวซ์จะถูกฟอสโฟรีเลตเพื่อผลิต 1,4' - ไดฟอสเฟต เตตระเดซิล กลูโคซามีน ไดแซ็กคาไรด์ ซึ่งก็คือไขมัน Ⅳ a (ไขมัน Ⅳ a)

4. การผลิตลิพิดเอ

การเปลี่ยนจากไขมัน Ⅳ a เป็นไขมัน A จำเป็นต้องเพิ่ม KDO ที่ตำแหน่ง C-6 ของกลูโคซามีนที่ไม่รีดิวซ์ จากนั้นเติมกรดไขมันอิ่มตัว 2 ชนิดและกลุ่มที่มีขั้ว เช่น ฟอสเฟต กลไกเฉพาะของปฏิกิริยานี้ยังไม่ชัดเจน